(1)两者定位是不同的：企业合规师专注于企业合规管理，涉及范围全面而广泛;而审计师偏向于传统的风险管控及审计方法。

(2)知识体系存在差异：企业合规师涉及内容非常广泛,包括企业法律法规的新政策与新变化、税务管理及政策、合规管理概要、合规管理模型框架、合规风险管理、税务风险管理与风控、合规管理制度和流程、关键合规风险识别与评估实战、合规管理内容体系设计、合规管理评价与绩效考核、实施合规管理机制、合规管理与税务风险控制的综合案例分析、合规管理人才培养与文化建设等。而审计师的内容包括控制环境与治理机制、风险导向审计、内部审计业务、智能分析与信息技术应用、内审流程管理与控制、采购审计与舞弊调查、经济责任审计、内审热点等内容等内容。

(3)考试题型合难易程度存在差异：而审计师考试，初、中级只考《审计专业相关知识》、《审计理论与实务》，考《经济理论与宏观经济政策》、《审计理论与审计案例分析》;而企业合规师主要以选择题和案例分析题分开两科考试，企业合规师的考试难度相对低一些，但是考核的知识面比审计师更广泛。企业合规师和审计师两者各有千秋，但是企业合规师的优势在于其代表着企业发展的方向，随着未来职业发展，都必将进入管理会计领域，并且在管理会计领域通过积累和沉淀可能会走向较高管理层，这是中级会计师不能相比的。

(4)职业发展不同：企业合规师的未来发展比较广泛，在认可度较高，各类中小型企业在招聘招聘具企业合规师证书的人才，可以在企业从事风险控制、合规管理、风险管理、法务管理、合规管理等。而审计师的发展通道有：会计、财务经理、财务总监、财务主管、会计主管、审计专员、审计经理、主办会计、审计主管、审计助理、财务会计、总账会计等岗位等岗位。